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医院怎么检查肠道菌群

2026年01月06日 15:16:50
病情描述:

医院怎么检查肠道菌群

医生回答(1)
  • 蓝宇
    蓝宇主任医师

    北京积水潭医院 向他提问

    医院检查肠道菌群主要通过粪便样本采集,结合分子生物学、代谢组学等技术,具体方法如下:

    一、样本采集

    1.样本类型:以新鲜粪便为主,必要时采用直肠拭子或肠道内容物(如内镜检查获取)。

    2.采集前准备:检查前3天停用抗生素、益生菌制剂及免疫抑制剂;素食者需提前2天告知医生;婴幼儿由家长协助留取≥5g样本,用专用无菌容器密封;孕妇避免空腹采集,糖尿病患者需监测血糖波动。

    3.保存要求:4℃冷藏不超过24小时,-80℃环境长期保存,避免反复冻融导致菌群结构破坏。

    二、主要检测技术

    1.高通量测序技术:①16SrRNA基因测序:通过扩增V4高变区,采用Illumina平台分析,可识别100+菌种,区分到属水平,适用于常规菌群结构筛查;②宏基因组测序:直接提取总DNA进行全基因组测序,覆盖功能基因,适用于复杂菌群代谢通路研究,需测序深度达30-50×以平衡准确性与成本。

    2.培养分离法:采用厌氧血琼脂培养基培养双歧杆菌、乳酸杆菌等优势菌,结合API生化鉴定系统,适用于检测可培养致病菌(如艰难梭菌),但仅能反映约1%可培养菌群。

    3.代谢组学分析:通过气相色谱-质谱联用(GC-MS)检测短链脂肪酸(SCFA)、次级胆汁酸,液相色谱-质谱联用(LC-MS)检测色氨酸代谢物,反映菌群功能活性,研究显示SCFA水平与肠屏障功能完整性相关。

    4.质谱快速鉴定:MALDI-TOF质谱直接分析菌落蛋白指纹,1小时内完成菌种鉴定,适用于临床快速筛查特定致病菌。

    三、特殊人群解读

    1.婴幼儿:6月龄内肠道菌群以双歧杆菌、乳酸杆菌为主,1岁后逐渐接近成人菌群结构;早产儿需建立单独参考区间,避免抗生素使用后的菌群重塑评估。

    2.老年人:菌群多样性较年轻人降低15%-20%,拟杆菌门相对丰度减少、梭菌目比例升高,需结合同年龄段健康人群基线数据解读。

    3.慢性病患者:肥胖人群普氏菌属增加、肠杆菌科过度增殖;糖尿病患者丁酸水平降低,与胰岛素抵抗呈负相关,需结合临床指标综合分析。

    注:所有检测结果需结合患者年龄、基础疾病及用药史综合解读,单次检测异常需复查确认。

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