肛门湿疹的病因分原发性和继发性两种，前者原因不明，后者多由肛瘘、肛裂等炎症或分泌物刺激所致。肛门湿疹是肛肠科常见的一种过敏性皮肤病。以瘙痒、有分泌物渗出、皮疹呈多形性、易复发为主要特点。
常见的肛门湿疹原因有
1、体质因素
有人认为素质差与本病有重要关系。
2、精神因素
精神紧张、劳倦、忧郁、失眠亦可引起。
3、炎热、潮湿、寒冷、日光等气候影响，亦是其致病因素
4、饮食因素
鱼、虾、蟹、牛羊肉、鸡蛋、葱、蒜、酒等。
5、肛门疾病
如痔疮、肛瘘、肛裂、肛门失禁、肛管上皮缺损等。
6、药物影响
磺胺类药物、某些抗生素及强酸、强碱等化学药品。
7、致敏物质
如花粉、灰尘、羊毛、人造纤维、香脂、染料、肥皂等。
8、疾病因素
如内分泌失调，肝肾功能紊乱，肠道寄生虫病，消化功能紊乱，妇女白带多，娆虫病等，均可引起或加重病情。
局部病变
如痔、肛瘘(肛瘘译：肛管直肠瘘是肛管或直肠与肛周皮肤相通的肉芽肿性管道，主要侵犯肛管，很少涉及直肠，故常称为肛瘘，内口多位于齿状线附近，外口位于肛周皮肤处。整个瘘管壁由增厚的纤维组织组成，内复一层肉芽组织，经久不愈。发病率仅次于痔，多见于男性青壮年，可能与男性的性激素靶器官之一皮脂腺分泌旺盛有关。)、肛裂、肛门失禁等疾病的慢性炎症刺激，也可诱发。
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【参考文献：《肛肠疾病诊断与治疗》《中西医结合肛肠病学》】