慢性肠炎泛指肠道的慢性炎症性疾病，其病因可为细菌、霉菌、病毒、原虫等微生物感染，亦可为过敏、变态反应等原因所致。
慢性肠炎的临床表现为长期慢性、或反复发作的腹痛、腹泻及消化不良等症，重者可有粘液便或水样便。日常生活中，容易诱发慢性肠炎的病因主要有以下几个方面。
遗传
本病的血缘家庭发病率较高，据欧美文献统计，溃疡性结慢性肠炎病人的直系血缘亲属中，约15-30%的人发病。
神经精神因素
患者多有某些性格特征，对于生活中重大事件的心理承受能力和适应性差，属心身疾病一类，心身疾病强调心理因素在疾病 的发生或病程中起重要作用。
自身免疫
随着社会发展，医学的进步，免疫学的快速成长，有很多不明病因的疾病可以探明。目前，免疫疾病的发病率高，治疗困难，已引起重视。
感染因素
感染，在结慢性肠炎病因中是主要病因之一。每当发病时，使用抗生素则有不同程度控病情和治疗效果，这说明与感染有关。人类是杂食性的，当吃了不结或变质的食物，往往会发生肠道病变，是占结慢性肠炎病因多数。