引起溃疡性结肠炎的原因至今尚未完全清楚，可但是经过了大量临床上的研究发现，又发溃疡性结肠炎发生的主要原因还是和人们生活和饮食习惯有着密不可分的关系，接下来就让我们具体的了解一下：
(1)感染因素
因本病的病理变化和临床表现与细菌性痢疾非常相似，有些病例粪便中能培养出细菌，部分病例应用抗生素有效，因而认为感染是本病的病因。但多年来反复研究还未能直接找到感染微生物学的根据。在溃疡性结肠炎的病人，约有0.5%一8.2%的病人由菌痢转变而来，因此还有人提出可能与自身免疫有关。
(2)精神因素
由于精神障碍引起植物神经功能失调，随之出现肠道运动亢进、肌肉痉挛、血管收缩、组织缺血、毛细血管通透性增加等，最终导致肠壁炎症及溃疡形成。
(3)遗传因素
在欧美国家，本病的发病率较高，并有较明显的家族性，种族间的发病率有明显差异，所以有人提出本病可能与遗传有关。
(4)大肠内酶的局部因素
肠壁分泌过多的溶菌酶、蛋白质分解酶等，破坏了粘液的保护作用，因而导致细菌的侵入，发生粘膜坏死。
(5)过敏反应
某些食物(如牛奶)可使少数病例病情复发。
(6)防御机能障碍
(7)自身免疫因素
由于本病常并发类风湿性关节炎、桥一本氏病、红斑狼疮等自身免疫性疾病，应用肾上腺皮质激素或其它免疫抑制剂治疗有一定效果，因此提示本病很可能为自身免疫性疾病。