性交障碍患者的临床表现一般都为性欲降低、无性快感，但实际上这类患者性欲减退只不过是病变的早期表现，其大多数都会出现其它性功能障碍，性交障碍可能存在身体或心理问题。
性欲缺乏
这可由于双方关系不良引起，如果过去有过良好关系，有时可通过心理咨询治疗得到恢复。如从未与对方有过好感，那就不是医疗问题。如果一方有兴趣而对方无兴趣，这可能是因为对方疲劳或其他原因引起，也可能是因对方的“挑逗活动“不足引起。女方对性交的恐惧也可以抑制性欲。治疗主要是向双方说明产生性欲缺乏的原因以寻求适当解决。
性器官反应缺乏
这在男方主要是阴茎不能勃起或不能维持勃起时间到插入阴道(称为勃起障碍或阳萎)，在女方则表现为阴道滑润性液体分泌缺乏或不足。从未有过勃起者称为原发性阳萎，但绝大多数都是继发性、一过性的阳萎。如果只是与妻子性交未果出现阳萎，则主要是由于焦虑引起，治疗应寻找和消除引起焦虑的原因。
如果阳萎不是“选择性”的，则应检查是否因其他疾病(包括精神疾病)或使用药物、酒精引起。女方缺乏阴道分泌主要由于性欲缺乏或挑逗不足引起。
性交疼痛
主要见于女方，可以由于性交时阴道分泌不足或局部炎症或男方动作粗暴等原因引起，一次这种疼痛的经验可以使以后的性交时因为害怕而产生阴道痉挛，从而出现疼痛。加强相互关心、改进性技巧、治疗局部疾病常可使疼痛减轻或好转。