有了腔隙性脑梗死说明脑小血管不健全，重点在于预防再发脑梗死，积极控制高血压、高脂血症、糖尿病、冠心病等。尤其高血压是本病的直接原因，虽然降压治疗并不能逆转高血压已造成的血管病变，但使血压逐渐降到正常水平，对本病的预防有重要意义，因持续的高血压将加重血管病变，促进动脉硬化和血管闭塞。
目前常见脑梗塞的治疗方法有
(一)溶栓治疗
即发病后3～6小时以内进行。可静脉给药溶栓，也可动脉给药溶栓，动脉溶栓未广泛应用于临床。常用药物有尿激酶、纤溶酶原激活剂(t-PA)。溶栓治疗脑梗塞的主要危险性和副作用是颅内出血，心源性栓塞脑出血的机会更高。
(二)抗凝治疗
常用的药物有肝素、低分子肝素，必须作凝血检测。主要的副作用是出血，其中低分子肝素较普通肝素更安全。
(三)降纤治疗
作用是增加纤溶系统活性和抑制血栓形成，达到治疗脑梗塞的目的，常用药物有降纤酶、东菱精纯克栓酶及蝮蛇抗栓酶等。发病24小时内使用。用药过程中应检测纤维蛋白原等。
(四)血液稀释疗法
是目前比较常用的治疗脑梗塞的方法，目的是降低血液粘稠度、改善微循环和补充血容量不足，常用药物有低分子右旋糖苷和706代血浆等。
(五)脑保护剂也可用于治疗脑梗塞
(1)钙离子拮抗剂
阻止细胞内钙超载、防止血管痉挛、增加血流量。常用药物有尼莫地平、尼卡地平、盐酸氟桂嗪和脑益嗪等。
(2)胞二磷胆碱
具有稳定细胞膜的作用。
(3)谷氨酸拮抗剂和GABA增强剂
(4)其它
维生素E、维生素C和甘露醇也具有抗氧化和自由基清除的作用。
目前尚无有效的治疗方法，与脑梗死相似，在综合治疗及个体化治疗的基础上，强调加强病因治疗，预防再次发病。
①有效控制高血压和各种类型脑动脉硬化可减少腔隙性卒中可能性，是预防本病的关键。
②没有证据表明抗凝治疗会带来任何益处，阿司匹林效果也不确定，但由于这些治疗发生严重并发症风险较低，故也经常应用。
③其他可适当应用扩血管药物如尼可占替诺(脉栓通)等增加脑组织血液供应，促进神经功能恢复;应用钙离子拮抗药如尼莫地平、氟桂利嗪等减少血管痉挛，改善脑血液循环，降低腔隙性梗死复发率。
④活血化淤类中药对神经功能恢复可有所裨益。
⑤控制吸烟、糖尿病和高脂血症等可干预危险因素。