2004年6月入选“2003中国50家佳运营绩效企业排行榜”

2005年荣获“广东省先进外向型民营企业突出贡献奖”和“广东省优秀民营企业称号”并入围“奥企百强”。

2007年7月健康元药业集团被评定为"深圳市民营领军骨干企业"。

2008年“健康元”品牌入围亚洲品牌500强。

2010年3月18日，健康元药业集团董事长朱保国当选“2009年广东省十大经济风云人物”

2010年7月，在“2009中国医药板块上市公司核心竞争力50强排行榜”中，健康元以30.5分的总成绩排名第三，“2009中国医药上市公司排行榜，化学制剂类上市公司核心竞争力排行榜（20强）”排名第二，“2009中国医药上市公司排行榜，医药上市公司赚钱榜（20强）”排名第八。