普通外科是医院的重点学科，承担着腹部疾病、胃肠外科疾病、甲状腺和乳腺疾病、肛肠疾病等常见病、多发病的诊治工作，现开展床位120张。技术力量雄厚：目前主任医师3人、副主任医师3人、博士生导师1人，硕士生导师1人，医学博士4人，医学硕士8人及其他医护人员共60余人。拥有肿瘤细胞培养实验室、电子胃肠镜室、乳管镜检查室、资料室等。每年收治病人3000余人次，手术2000余例。近年来承担军队及地方医疗卫生科研课题多项，获得中华医学科技奖二等奖1项、北京科技奖二等奖1项、军队医疗成果二等奖2项、北京金桥工程奖三等奖1项、军队科技进步奖三等奖及以下共8 项。分为胃肠肿瘤外科治疗中心；糖尿病外科手术治疗中心；乳腺病治疗中心；甲状腺疾病治疗中心；血管疾病外科治疗中心等多个亚学科中心。 2009年依托娴熟胃肠手术的经验独立开展糖尿病胃转流手术。已完成近百例糖尿病手术治疗，效果满意。