如何进行蛋白组分析问
如何进行蛋白组分析
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样本采集依类型规范操作,不同年龄人群有别,特殊疾病状态等需明病史;样本制备中蛋白提取据类型选裂解液并依人群调条件,蛋白纯化用亲和层析法;蛋白定量用BCA法,注意样本稀释度;蛋白分离有二维电泳和液相色谱并依人群调参数;蛋白鉴定用质谱技术并考虑病史影响;数据分析用生物信息学软件经数据库功能注释和通路分析,考虑相关因素统计分析保结果可靠。
一、样本采集
样本采集需依样本类型规范操作。组织样本选取具代表性部位,采集后迅疾处理,若长时保存置-80℃速冻;体液样本如血液需选适配抗凝剂避溶血,尿液样本防污染保纯净。不同年龄人群样本采集有别,儿童样本量依体重控,老年人群操作轻柔减组织损伤;性别无特殊差异,特殊疾病状态下需明病史;长期饮酒者血液蛋白成分异,采集告之生活方式;患代谢病者体液等蛋白谱异常,采集明病史助综合考量。
二、样本制备
1.蛋白提取
据样本类型选裂解液,细胞样本用含蛋白酶抑制剂裂解液,如动物细胞用RIPA裂解液,低温(4℃左右)振荡或超声使细胞充分裂解,防蛋白变性。儿童样本裂解条件温和,老年样本蛋白易聚集,调超声时间等。
2.蛋白纯化
存杂质时用亲和层析法纯化,如组氨酸标签蛋白用镍离子亲和柱,经平衡、上样、洗涤、洗脱得较纯目标蛋白,严控实验条件保蛋白完整性与活性。
三、蛋白定量
BCA法为常用,原理是试剂与肽键反应成紫色复合物,测吸光度算浓度。配标准蛋白溶液系列绘标准曲线,样本与试剂混合孵育后测吸光度,据曲线算浓度。注意样本稀释度,高蛋白饮食人群调稀释比例。
四、蛋白分离
1.二维电泳
第一向等电聚焦依等电点分离,样本加含两性电解质凝胶电场下移至等电点;第二向SDS-PAGE依分子量分离,胶条放含SDS凝胶电场下按分子量分,调电压电流等条件。老年样本蛋白分子量分布有特点,调电泳参数。
2.液相色谱分离
反相高效液相色谱用疏水性固定相,流动相为水与有机溶剂梯度洗脱,依理化性质分离蛋白,优化流动相条件适配不同生活方式人群蛋白组成。
五、蛋白鉴定
质谱技术为关键,MALDI-TOF-MS将分离蛋白点酶解成肽段,肽段溶液与基质涂布靶板,激光照射离子化,飞行时间质谱测分子量并数据库比对。考虑不同病史蛋白修饰差异,保鉴定准确性。
六、数据分析
用生物信息学软件,经GO数据库功能注释(分子功能、生物过程、细胞组分),KEGG数据库通路分析,分析蛋白在疾病通路变化。考虑不同年龄、性别、生活方式、病史影响,统计分析并数据校正保结果可靠。
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