种子含番木瓜甙及芥子酶，前者和芥子甙类似，水解后产生刺激性挥发物。
果实的浆汁对豚鼠子宫有明显的加强收缩作用，据云种子有堕胎作用，曾用作通经剂及抗刺激剂。
木瓜富有营养，低卡路里，以致对进行减肥的人大有益处。
木瓜有助于治皮外伤或其它外伤;木瓜富有抗炎化合物，也有抗癌作用，对于患骨质疏松症、关节炎和浮肿的人，好有规律地食用木瓜，同时能够防癌。
木瓜也能帮助头皮和头发的健康，木瓜的摄入量有助于头发的生长并能防止头皮屑(头垢)。
木瓜是有功效排毒方法之一，多吃木瓜酒能排出体内的毒素。
对于患便秘和消化不良的病人，多吃木瓜能减轻病状。
番木瓜果皮光滑美观，果肉厚实细致、香气浓郁、汁水丰多、甜美可口、营养丰富，有“百益之果”、“水果之皇”、“万寿瓜”之雅称，是岭南四大名果之一。
木瓜富含17种以上氨基酸及钙、铁等，还含有木瓜蛋白酶、番木瓜碱等。半个中等大小的木瓜足供成人整天所需的维生素C。
木瓜在中国素有“万寿果”之称，顾名思义，多吃可延年益寿。
番木瓜用途广，既是果树，又是原料作物。成熟的果实，营养丰富，维生素C含量高，可助消化、治胃病。
未成熟的青果，除可作蔬菜食用外，还可腌制、蜜饯，制作果酱和果汁罐头，又是很好的饲料。
青果含有丰富的木瓜蛋白酶，在医药、食品、制革、纺织及美容上广泛应用，是木瓜酶工业的主要原料。
番木瓜和木瓜的区别主要就是表现在科属和作用方面，番木瓜就是我们平时吃的木瓜啦。
