化湿和胃
石菖蒲辛苦气香，入胃经则能宣化湿浊、开胃消食，乃化湿和胃良药。
《本草备要》谓其“去湿逐风，脘痞不饥者，症见：胃脘胀满闷痛、饮食无味、食欲不振、形瘦体倦、苔腻脉细等，用之多效。
皆取其苦燥除湿、辛香宣散、利窍开胃、消积宽中之功也。
散寒除痹
石菖蒲芳香辛温，温可胜寒，辛香散湿;更走中焦、则可开发脾胃之气雨除风寒湿痹。
正如《本草求真》谓：“《本经》首言治风寒湿痹，是取其辛温开发脾气之力。”本品既“主的肢湿痹，不得屈伸”(《名医别录》)，亦治邪风冷痹、身体俱痛，如(《圣济总录》菖蒲散)，以本品配乌头等，治冷痹身痛。
去湿止痒
石菖蒲辛苦而温，辛温能化湿，苦燥可杀虫，故本品外用涂敷，有去湿疗疮、杀虫止痒之功。
《药性论》亦载，本晶“杀诸虫，治恶疮疥瘙。”对皮肤湿疮、疥癣等疾，皆可应用。
如《济急仙方》以菖蒲配蛇床子组方、为末涂搽，主治：阴汗湿痒。
开窍宁神
用于湿浊蒙蔽清窍之神志昏乱及健忘、耳鸣、耳聋。本品芳香开窍、宁心安神，兼有化湿、豁痰、辟秽之功。本品单用或配伍平肝、安神药同用，又可治癫狂、痴呆等证。
抗惊厥
本品所含其β-细辛醚有抗惊厥作用。
改善记忆
其水煎醇沉液具有增智、促进记忆获得、改善记忆障碍的作用。
