肛门湿疹的治疗包括一般治疗、药物治疗、物理治疗和中医治疗。一般治疗需避免刺激因素、保持肛门清洁干燥；药物治疗有外用糖皮质激素、钙调神经磷酸酶抑制剂、收敛止痒剂及口服抗组胺药；物理治疗采用窄谱中波紫外线疗法且要注意儿童防护；中医治疗有中药外洗和内服，中药外洗需注意温度，内服方剂由专业中医师辨证开具。
保持肛门清洁干燥：建议患者每天用温水清洗肛门局部，但要注意避免使用刺激性强的肥皂等清洁剂。清洗后轻轻擦干，保持肛门局部的清洁干燥。对于婴幼儿患者，家长在清洗时动作要轻柔，清洗后可适当涂抹一些安全的润肤剂，保护皮肤屏障。
药物治疗
外用药物
糖皮质激素：如氢化可的松乳膏等，具有抗炎、抗过敏的作用。但对于儿童患者，应谨慎使用，尽量选择弱效的糖皮质激素，且避免长期大面积使用，以防出现皮肤萎缩等不良反应。对于成人患者，可根据病情适当使用，但也需遵循短期、小面积使用的原则。
钙调神经磷酸酶抑制剂：如他克莫司软膏等，适用于不宜使用糖皮质激素的部位，如肛周皮肤薄嫩处。其作用机制是通过抑制钙调神经磷酸酶来发挥抗炎作用。对于儿童患者，使用时需在医生指导下谨慎应用。
收敛止痒剂：如氧化锌油等，具有收敛、保护和止痒的作用。可用于肛门湿疹伴有渗出不多的情况。对于婴幼儿患者，氧化锌油相对较为安全，可在医生建议下使用。
口服药物
抗组胺药：如氯雷他定等，具有抗过敏、止痒的作用。可缓解肛门湿疹引起的瘙痒症状。对于儿童患者，应根据年龄和体重选择合适的剂量，且要注意药物可能引起的嗜睡等不良反应，在用药期间避免从事需要高度集中注意力的活动，如驾驶等。成人患者也可根据自身情况选用，服用后若出现明显不适需及时就医调整用药。
物理治疗
紫外线疗法：窄谱中波紫外线（NB-UVB）治疗肛门湿疹有一定疗效，其机制可能与调节免疫系统、抑制炎症反应等有关。但在治疗过程中需要严格控制照射剂量和频率，儿童患者进行紫外线治疗时要特别注意防护，避免照射到正常皮肤，且需在专业医生的操作下进行。
中医治疗
中药外洗：可根据患者的病情辨证选用中药方剂进行外洗，如苦参汤等，具有清热燥湿、止痒的作用。但中药外洗的具体配方需由专业医生根据患者的个体情况辨证开具，儿童患者使用中药外洗时要注意药物温度，避免烫伤皮肤。
中药内服：根据中医辨证论治原则，如属于湿热下注证，可选用龙胆泻肝汤等方剂进行内服治疗，以清热利湿。但中药内服的方剂和剂量需要由专业中医师根据患者的具体病情、体质等因素进行开具，儿童患者用药时要严格遵循中医儿科的用药原则，注意药物的剂量和配伍禁忌。
