一般治疗需积极寻找诱因避免刺激因素如过敏物质局部感染等避免搔抓摩擦不用热水肥皂水烫洗肛门穿宽松棉质内裤保持清洁干燥肠道寄生虫感染患儿需驱虫治疗药物治疗外用有糖皮质激素药膏（注意长期用不良反应儿童慎用弱效且时间不宜长）、钙调神经磷酸酶抑制剂（适用于不宜用糖皮质激素部位有局部灼热感等）、收敛止痒药物（皮肤无破损时用）；口服有抗组胺药物（抗过敏止痒儿童需调剂量注意嗜睡等不良反应）中医治疗有中药外洗（辨证用清热利湿祛风止痒方剂儿童注意药物温度）、中药内服（辨证分型用药儿童注意剂量性味影响）物理治疗有紫外线疗法（窄谱中波紫外线治疗有疗效需专业设备医生操作注意保护正常皮肤儿童严格掌握剂量。
避免刺激因素：应积极寻找可能的诱因，如过敏物质、局部感染等。避免搔抓、摩擦患处，不用热水、肥皂水烫洗肛门局部，尽量穿宽松、棉质的内裤，保持肛门局部清洁、干燥。例如，若患者对某些化纤材质的内裤过敏，更换为棉质内裤后可能减轻肛门湿疹症状。对于有肠道寄生虫感染的患儿，需及时进行驱虫治疗，因为肠道寄生虫感染可能诱发肛门湿疹。
药物治疗
外用药物
糖皮质激素药膏：如氢化可的松乳膏等，具有抗炎、抗过敏的作用。但要注意，长期使用可能会引起皮肤萎缩、毛细血管扩张等不良反应。对于儿童患者，应谨慎使用弱效的糖皮质激素药膏，且使用时间不宜过长。例如，2岁以下儿童使用时需更加严格遵循医嘱，因为儿童皮肤薄嫩，更易吸收药物导致不良反应。
钙调神经磷酸酶抑制剂：如他克莫司软膏等，适用于不宜使用糖皮质激素的部位，如面部、颈部等，也可用于肛门湿疹。其不良反应相对较少，但可能会有局部灼热感等。
收敛止痒药物：如氧化锌软膏等，有收敛、保护皮肤及止痒的作用，可用于肛门湿疹的治疗，尤其适用于皮肤无破损的情况。
口服药物
抗组胺药物：如氯雷他定等，具有抗过敏、止痒的作用，可缓解肛门湿疹引起的瘙痒症状。对于儿童患者，需根据年龄和体重调整药物剂量，且要注意药物可能引起的嗜睡等不良反应，在用药期间避免从事驾驶等需要高度集中注意力的活动。
中医治疗
中药外洗：可选用一些具有清热利湿、祛风止痒功效的中药方剂进行外洗，如苦参汤等。但中药外洗的具体方剂需根据患者的病情、体质等因素由医生辨证后开具，儿童患者进行中药外洗时要注意药物温度，避免烫伤皮肤。
中药内服：根据患者的辨证分型给予相应的中药内服，如湿热下注型可选用龙胆泻肝汤加减等。但中药内服也需在医生的指导下进行，儿童患者用药时要注意药物的剂量和性味等对儿童体质的影响。
物理治疗
紫外线疗法：窄谱中波紫外线（NB-UVB）治疗肛门湿疹有一定的疗效，其机制可能与抑制炎症反应等有关。但紫外线治疗需要专业的设备和医生操作，且治疗过程中要注意保护周围正常皮肤，避免过度照射。对于儿童患者，进行紫外线治疗时要严格掌握剂量等参数。
